泉州海外交通史博物馆在开元寺东侧。１９５９年创建。是一所通过文物陈列，反映中外人民友好往来来历史的专馆。

现设三个专题陈列室：

１、泉州湾古船陈列馆，陈列１９７４年泉州湾后渚港出土的宋代海船及其出土文物，分为门厅、海船出土文物陈列室和船厅三个部分，反映我国宋代造船业的发达和成就。

２、泉州海外交通史石刻陈列馆，陈列宋元时期宗教石刻２３１方，分为伊斯兰教石刻、景教石刻、摩尼教遗址及遗物照片和娑罗门教寺建筑构件四个部分，反映古代中外人民友好相处的历史和文化艺术交流的成果。

３、泉州外销陶瓷陈列馆，陈列三百多件陶瓷展品。反映中外人民经济文化交流和友好往来日益发展的情况。