南京医科大学是中国著名高等院校之一，其前身是江苏医政学院、国立江苏医学院，创建于1934年，1957年改名为南京医学院。1993年经国家教委批准，更名为南京医科大学。

目前，学校设有基础医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、第三临床医学院、口腔医学院、公共卫生学院、药学院、护理学院、医政学院、康达学院和成人教育学院，有3个七年制专业、23个本科专业方向，有2个博士后流动站、10个博士学位授权点、44个硕士学位授权点，有12所附属医院、29所教学医院、24个实习基地（江苏省卫生厅、南京市卫生局、江苏省及各市疾病预防控制中心和卫生监督所、专科医院等），有11个研究所、16个研究中心、5个江苏省重点实验室、7个江苏省重点学科。

学校图书馆藏书42万册，期刊近1万钟，是江苏省医学图书中心馆和高校文献保障系统医学文献中心。学校是中国国家卫生部认可的全国进修基地，接受国内外高访学者、留学生和港澳台学生。学校现有教授198人，副教授549人，博士生导师62人，硕士生导师278人。各类在校学生数8000余人。本科毕业生品学优良者，均可被授予学士学位。

60多年来，南京医科大学共为国家培养了1300多名博士、硕士研究生和2万多名毕业生，他们大多分布在江苏省及全国各地医院、防疫站、医学研究机构和卫生行政部门，不少毕业生已成为国内著名医学专家和学者。改革开放以来，学校已与美国、日本、加拿大、法国、德国、英国、奥地利、澳大利亚、俄罗斯、香港等国家和地区的医学院校、科研机构、医院建立了双边合作、学术交流关系，并聘请了一批知名专家、学者担任学校名誉教授、客座教授。学校还先后派出400余名教师出国考察、留学进修、访问讲学。